El laboratorio de Bioinformática tiene como objetivo aplicar la biología computacional para el análisis de datos biológicos. Evaluamos la diversidad genética y genómica de especies silvestres, consideradas en riesgo desde el punto de vista de la conservación, especies de importancia por el servicio que brindan en los ecosistemas o especies de valor comercial. A partir de genes, de representaciones reducidas de los genomas o de genomas mitocondriales analizamos:
• Diversidad genética en las poblaciones
• Demografía
• Adaptación y evolución de especies
A partir de la diversidad estructural de los genomas inferimos los mecanismos que modelan la variabilidad en las poblaciones.
Biotecnología agroalimentaria, acuícola y pecuaria
•Composición del bacterioma de bagre de canal (Ictalurus punctatus).
•Minería de datos genómicos de atún aleta negra (Thunnus atlanticus).
Biotecnología Ambiental y Manejo sustentable de recursos
•Genética de conservación de tortuga lora (Lepidochelys kempii), especie en peligro crítico de extinción.
Con alcance en los objetivos prioritarios 1 y 6.
Maestría Guadalupe Moncerrat González Roldán. 2019-2021 Maestría en Ciencias en Biotecnología Genómica – IPN. •Identificación de alelos del gen MHC clase II β asociados a la resistencia a ectoparásitos en Ictalurus punctatus. 2022.
Jaime Alberto Morales Baquera. 2020-2022. Maestría en Ciencias en Biotecnología Genómica – IPN. •Análisis bioinformático e identificación de genes asociados con metabolitos antioxidantes en Rubus adenotrichos.
1) Mendoza‐Pacheco, O., Parra‐Bracamonte, G. M., De la Rosa‐Reyna, X. F., Sifuentes‐Rincón, A. M., Montelongo‐Alfaro, I. O., & Lara‐Rivera, A. L. (2021). Novel polymorphisms in Stearoyl‐CoA Desaturase (SCD) and Fatty Acid Desaturase 2 (FADS2) in channel catfish (Ictalurus punctatus, Rafinesque, 1818). Journal of Applied Ichthyology, 37(1), 120-124.
Difusión de la ciencia en nivel básico, medio y superior.
INSTITUTO POLITÉCNICO NACIONAL
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